卫生署卫生防护中心辖下的「疫苗可预防疾病科学委员会」从公共卫生的角度就「香港儿童免疫接种计划」提出建议，而母婴健康院是按照「香港儿童免疫接种计划」为初生至五岁的婴幼儿童提供免疫接种服务。
小学学童则由卫生署辖下的学童免疫注射小组到学校提供接种服务。卫生署建议儿童根据通常居住地的免疫接种计划接种疫苗，对儿童传染病有全面保护，并不建议在外游期间接种疫苗。
*2018年7月1日或以后出生的儿童会于18个月大在母婴健康院接种麻疹、流行性腮腺炎、德国麻疹及水痘混合疫苗。2013年1月1日至2018年6月30日出生的儿童会于小学一年级接种麻疹、流行性腮腺炎、德国麻疹及水痘混合疫苗。
^由2019/20学年起，合资格的女学童会于小学五年级接种「九价人类乳头瘤病毒疫苗 – 第一次」，并于下一学年（小学六年级）接种第二次。
小孩如若离港前往其他地方，请紧记在当地安排免疫接种。
除了上述疫苗外，个别私家医生可以为儿童接种其他疫苗，例如流行性感冒疫苗、乙型流感嗜血杆菌疫苗、脑膜炎双球菌疫苗、甲型肝炎疫苗、日本脑炎疫苗、轮状病毒疫苗及一些包含多种疫苗成分的「多合一」疫苗。如家长希望为子女接种这些疫苗，应先请教医生。
